În 11 august 2008, Cătălin Predoiu, ministrul Justiţiei din Guvernul Tăriceanu, anunţă că nu îl va propune pe Daniel Morar pentru un nou mandat de procuror şef al DNA. Predoiu îşi motivează decizia prin lipsa de performanţă a lui Morar, prin „vulnerabilităţi instituţionale”, prin cheltuirea unor sume mari de bani pentru derularea unor anchete cu „rezultate discutabile”, prin rezultatele slabe în teritoriu, prin „eşecuri în unele dintre dosare”. În plus, potrivit lui Cătălin Predoiu, „nu putem ignora opiniile unor specialişti reputaţi în sistemul judiciar, judecători şi procurori, care acuză de mai mult timp lipsa de acurateţe în cazul unor anchete, formularea unor acuzaţii în lipsa unor probe solide, dublate de expunerea lor opiniei publice, ignorarea procedurilor şi modul de procesare în interior a informaţiilor şi lucrărilor sau maniera de lucru şi comunicare cu procurorii de caz”. Ministrul Predoiu o propune pe Monica Şerbănescu pentru şefia DNA, propunere respinsă de CSM şi, ulterior, de preşedintele Traian Băsescu.
Daniel Morar este însă omul lui Băsescu şi acesta îl vrea cu orice preţ la conducerea Departamentului Naţional Anticorupţie. După ce candidează fără succes din partea PNL la alegerile parlamentare din 2008, Predoiu îi trădează pe liberali şi i se alătură lui Traian Băsescu, menţinându-şi astfel postul de ministru al Justiţiei şi în Guvernul Boc, instalat în decembrie 2008.
În 30 ianuarie 2009, la şase luni după ce îl desfiinţase public, ministrul Cătălin Predoiu îl propune pe Daniel Morar pentru şefia DNA. Odată cu schimbarea taberei politice, părerile lui Predoiu despre Daniel Morar se schimbă şi ele radical. Ministrul declară acum că propunerea de reînnoire a mandatului lui Morar este motivată de „activitatea profesională anterioară a domnului Daniel Morar”, de „aprecierea constantă a DNA în rapoartele de ţară a Comisei Europene”, de „susţinerea procurorului general al României” şi de „imaginea României şi a justiţiei din România”. Dar argumentul cel mai puternic pentru numirea lui Daniel Morar la conducerea DNA este, potrivit consecventului ministru al Justiţiei, Cătălin Predoiu, chiar „încrederea ministrului Justiţiei în capacitatea profesională a domnului Daniel Morar, în determinarea sa de a continua combaterea corupţiei, în păstrarea independenţei sale în activitatea viitoare, în disponibilitatea de a creşte cooperarea interinstituţională cu DIICOT şi determinarea de a asigura eficienţa investigaţiilor DNA în contextul respectării drepturilor omului şi a principiului prezumţiei de nevinovăţie”. În 12 februarie 2009, preşedintele Traian Băsescu îl reînvesteşte pe Daniel Morar în funcţia de procuror şef al DNA
